Возможно, предпочтение было отдано голландской цветовой гамме, так как Нидерланды на тот момент являлись главной мировой морской державой, опережая по количеству судов всех своих конкурентов вместе взятых. Еще одной причиной называют то, что белый, синий и красный были цветами герба Москвы, но истинной причины выбора никто точно не знает.
По поводу дизайна флага, который поднимали на корме «Орла», тоже нет полной ясности. Есть по крайней мере три варианта того, каким он мог быть: первый – тот самый перевернутый голландский триколор, второй – прямой синий крест с расположенными по диагонали двумя белыми и двумя красными сегментами, третий – это по сути наш сегодняшний президентский штандарт, то есть три полосы (белая, синяя и красная) с расположенным по центру двуглавым орлом.